PalmDB downloads


palmdb-2023-04.tar.gz # all files in one tarball (4.6Gb)

PalmDB
├── final # Palmprints and mapping for all datasets combined.
│   ├── label_sotu.tsv
│   ├── sotu_datasets.tsv
│   ├── sotu_labels.tsv
│   ├── sotus.palmprint.faa
│   └── unique.palmprint.faa
├── palmcore
│   ├── edgar2022.palmcore.faa
│   ├── edgar2023.palmcore.faa
│   ├── genbank2022.palmcore.faa
│   ├── hou2023.palmcore.faa
│   ├── ictv2021.palmcore.faa
│   ├── neri2022.palmcore.faa
│   ├── wolf2018.palmcore.faa
│   ├── wolf2020.palmcore.faa
│   └── zayed2022.palmcore.faa
├── palmprint
│   ├── edgar2022.palmprint.faa
│   ├── edgar2023.palmprint.faa
│   ├── genbank2022.palmprint.faa
│   ├── hou2023.palmprint.faa
│   ├── ictv2021.palmprint.faa
│   ├── neri2022.palmprint.faa
│   ├── wolf2018.palmprint.faa
│   ├── wolf2020.palmprint.faa
│   └── zayed2022.palmprint.faa
├── fragment
│   ├── edgar2022.fragment.faa
│   ├── edgar2023.fragment.faa
│   ├── genbank2022.fragment.faa
│   ├── hou2023.fragment.faa
│   ├── ictv2021.fragment.faa
│   ├── neri2022.fragment.faa
│   ├── wolf2018.fragment.faa
│   ├── wolf2020.fragment.faa
│   └── zayed2022.fragment.faa
├── raw
│   ├── edgar2022.full_contigs.fna
│   ├── edgar2022.micro_contigs.fna
│   ├── genbank2022.cds.faa
│   ├── hou2023.contigs.fna
│   ├── ictv2021.fna
│   ├── neri2022.intact.faa
│   ├── wolf2018.faa
│   ├── wolf2020.faa
│   └── zayed2022.contigs.fna
├── sotus # Palmprint sOTUs constructed for each dataset separately
│   ├── edgar2022.sotus.faa
│   ├── edgar2023.sotus.faa
│   ├── genbank2022.sotus.faa
│   ├── hou2023.sotus.faa
│   ├── ictv2021.sotus.faa
│   ├── neri2022.sotus.faa
│   ├── wolf2018.sotus.faa
│   ├── wolf2020.sotus.faa
│   └── zayed2022.sotus.faa
└── dataset_maps
├── edgar2022.sotu.tsv
├── edgar2023.sotu.tsv
├── genbank2022.sotu.tsv
├── hou2023.sotu.tsv
├── ictv2021.sotu.tsv
├── neri2022.sotu.tsv
├── wolf2018.sotu.tsv
├── wolf2020.sotu.tsv
└── zayed2022.sotu.tsv